BoBoiBoy Galaxy (Phần 3) xoay quanh câu chuyện về những siêu nhân nhí mang trong mình sức mạnh to lớn. Họ phải hợp tác với nhau mang trong mình sứ mệnh bảo vệ dải ngân hà khỏi những kẻ xấu xa. Power Spheras là những robot công nghệ cao mang theo sức mạnh không thể tưởng tượng và bị nhiều người truy bắt, những robot này đã lẩn trốn và ẩn mình ở khắp các vùng của thiên hà nhưng cũng không thoát khỏi nanh vuốt kẻ xấu. Siêu anh hùng BoBoiBoy của Trái Đất làm thế nào để cứu những Power Spheras?. Các phần trước: Phần 1, Phần 2.
